Archivado en: General | Etiquetas: Biochemical Journal, Edición semántica, Semantic publishing, Web semántica
La editorial Portland Press Limited pone en marcha un nuevo concepto de artículo científico editado en formato PDF interactivo. Este proyecto se desarrolla en su revista insignia, Biochemical Journal.
Portland Press se ha decantado por el software de publicación semántica Utopia. Este software ha sido desarrollado por School of Computer Science de la Universidad de Manchester.
En un primer estadio los desarrolladores se centraron en la creación de una serie de herramientas interactivas para el análisis de la secuencia y estructura de las proteínas, pero posteriormente ampliaron sus objetivos a otras áreas de la biología, ciencias de la vida y de la salud.
Las funcionalidades que este sistema de publicación semántica introduce en el formato PDF coinciden con algunas de las mejoras semánticas añadidas en los documentos HTML, Adventures in Semantic Publishing: Exemplar Semantic Enhancements of a Research Article, David Shotton, Portwin K, Klyne G, Miles A.
El PDF semántico convierte las imágenes estáticas, tablas y texto en objetos que contienen hipervínculos y que pueden ser visualizados, anotados y analizados interactivamente. Los términos y frases contienen links a web externas, glosarios y bases de datos. Y datos de valor añadido como vídeos e imágenes pueden ser embebidos en el texto con links a herramientas interactivas para manipular secuencias de las proteínas y ver las estructuras moleculares en 3D.
Biochemical Journal ofrece los artículos en PDF convencional y PDF enriquecido. Sin embargo para visualizar y utilizar todas las funcionalidades del nuevo PDF es necesario descargarse en el PC o Mac el sotfware Utopia, descarga sumamente fácil y rápida.
Archivado en: General | Etiquetas: CIARD RING, open access, Open Archives Iniciative
Quisiera desde este pequeño blog, contribuir a la difusión de esta iniciativa, que consiste en recopliar datos e información sobre estado del Acceso Abierto (OA) y la Open Archives Initiative (OAI), en la Comunidad de la Investigación en Agricultura.
El proyecto parte del CIARD (Coherence in Information for Agricultural Research for Development) y se denomina Routemap to Information Nodes and Gateways (RING).
El resultado de la encuesta estará disponible a finales de enero de 2010 en la web del CIARD RING.
Y tal como se explica en la web, difilmente se pueden crear servicios de valor añadido sin saber lo que efectivamente ya está hecho. Así que una vez recopilada la información pertinente, se trata de recuperar el vínculo perdido entre los servicios existentes y sobre ellos crear otros nuevos.
La encuesta está disponbible en español, inglés y francés.
Y añado un slide de Stephen Rudgard en el que se expone con claridad meridiana la importancia de una organización como CIARD.
El próximo 11 de noviembre se celebrará la cuarta edición de Blogs. La conversación, en la Universidad Politécnica de Madrid.
Creo que se trata de una cita intersantísima tanto por el contenido, como por los ponentes y organizadores.
Organizadores:
Octavio Isaac Rojas Orduña Director general de túatú social media & pr.
Elvira San Millán, responsable del programa de Universidad Digital Saludable, URJC, vinculada con la RSC, y community manager del Instituto de Humanidades URJC
Elena Berga, asesora estudiantes de ingeniería en la UPM y de públicos heterogéneos
Contenidos:
RRPP en un mundo híperconectado
Revolución Política en Internet
Las Crisis e Internet
Blogs y Nostalgia
Y como novedad, I Concurso Iberoamericano de VideoBlogs y además después se celebrará otro beers and blogs.
Altamente recomendado para todos aquellos que crean en la red y la libre comunicación.
Archivado en: General | Etiquetas: Bibliotecas 2.0, Blogs científicos y académicos, Comunicación científica y académica, Recursos 2.0, Web 2.0
La comunicación científica y académica está modificando sus parámetros de actuación debido a la irrupción y asentamiento de las herramientas 2.0 en este ámbito, sin llegar a producir un desplazamiento de los canales tradicionales de difusión (revistas, revisión por pares, métricas).
Tal vez en las universidades españolas la credibilidad de todo este entorno comunicativo digital aún produce dudas y reticencias, tanto por parte de docentes como de bibliotecarios, un tanto asustados por la avalancha de tal cantidad de nuevos recursos informacionales de difícil localización y gestión.
Sin embargo, las universidades americanas no dudan a la hora de reconocer todo este conocimiento producido a través de estos canales no oficiales de información, incluyéndolos como citas en artículos y ponencias. El incremento cuantitativo y cualitativo ha sido exponencial en los últimos tres años.
Una de las herramientas 2.0 más utilizadas, accesibles, y también denostadas, son los blogs, sin embargo los blogs académicos y científicos revisten ciertas características que los diferencia del resto del gran abanico de blogs generalistas.
Sobre ellos han escrito con gran maestría y conocimiento de causa, Daniel Torres-Salinas, Alvaro Cabezas Clavijo y Tíscar Lara.
Daniel Torres-Salinas y Alvaro Cabezas Clavijo, en Los Blogs como Nuevo Medio de Comunicación Científica, relacionan cuatro utilidades de un blog científico:
Medio de publicación sin intermediarios.
Tablón de anuncios y repositorio personal o colectivo.
Blog como medio de difusión selectiva de la información.
Acercar la ciencia al público no especializado.
Tíscar Lara, realiza un excelente análisis de la utilidad de un blog académico, presentándonos las motivaciones (qué aporta un blog académico):
Gestión de la Comunicación interna y externa (individual y grupalmente).
Organización de la documentación.
Hábito de lecturas actualizadas.
Banco de pruebas de ideas. Feedback de públicos diversos. Ejercicio de la Didacticidad.
Divulgación científica no mediatizada. Contacto directo con los lectores.
Nuevos campos para la publicación. Los círculos académicos son de difícil acceso y limitada distribución.
Construcción de una identidad como autores.
Transparencia de los procesos científicos. Valor añadido de los descartes.
Contextualización de información existente en la red.
Nuevas redes sociales y entornos de relación. Transciende barreras espacio-temporales (departamento, congresos, etc.)
Y qué permite el blog como espacio de publicación
Flexibilidad de plazos, estilos, etc.
Actualización y revisión constante.
Pacto de lectura “work in progress” que acoge la rectificación.
Trabajar en procesos dialógicos, en constante testeo y reestructuración.
Manejar datos provisionales.
Negociar los discursos científicos con la sociedad. Tener un sentimiento directo de cómo son asimilados.
Construir conocimiento en Red de forma colaborativa (tagging, wikis, del.icio.us, etc.
Ante estos argumentos poco cabe que decir al respecto, críticas, sí pero también fácilmente superables:
Falta de credibilidad, subsanable con indicación del autor, filiación profesional, currículum, e incluso señalando otros blogs o trabajos de investigación en los que se haya citado post del propio blog.
Plagio, corta y pega, subsanable con indicación de las fuentes. Si estas son digitales, inclusión del link.
Longevidad e irregularidad, subsanable con una audiencia fiel que seguirá contenido de alta calidad académica a través de lectores de RSS.
Nichos de audiencia reducida, subsanable mediante una correcta política de recolección y difusión por parte de los bibliotecarios científicos.
Comentarios no correctos políticamente hechos a un post que luego puedan influir negativamente en la carrera profesional de la persona que los haya hecho. La reputación digital es asunto particular e intransferible de cada persona, y aún más en el caso de la comunidad académica.
A sensu contrario, comentarios carentes de veracidad, maliciosos, etc que puedan empañar la calidad de las aportaciones de los lectores. Subsanable con el requisito de identificación y filiación.
Inconsistencia de la información, subsanable por la propia naturaleza de un blog científico, que es un estadio intermedio o un acercamiento preliminar a un trabajo de investigación.
A mi juicio, los blogs científicos y académicos constituyen una importante fuente de información en acceso abierto, libre de censuras, información en estado puro lista para ser compartida, mejorada, transformada y enriquecida.
Pero para que blog responda a su naturaleza de recurso abierto, innovador y provocador de nuevas ideas y estudios, han de respetarse las reglas del fair play científico, tanto por parte de los blogeros como de los usuarios.
O 100 Ways to Use Twitter In Your Library, post de Adrienne S. Carlson, en su blog, Accelerated Bachelor Degree.
La autora agrupa los distintos usos de Twitter dentro de una biblioteca, en varias aplicaciones temáticas:
Referencia, Twitter puede ayudar a los bibliotecarios de referencia a dinamizar el uso de su sección
Discusión, a través de Twitter se puede crear un canal directo de comunicación entre la biblioteca y la comunidad
Anuncios y actualizaciones, utilizando Twitter los bibliotecarios pueden destacar nuevos materiales, grupos de discusión, noticias, etc.
Recopilación de feed de varias bibliotecas que pueden servir como ejemplos
Colegas, estudiantes y amigos, Twitter permite la conexión entre bibliotecarios, estudiantes y amigos
Varias aplicaciones basadas en Twitter que pueden ser útiles para la biblioteca
Editores y agencias de suscripciones que utilizan Twitter
Sin embargo el post es abierto, la autora anima a los bibliotecarios a intentar algunas de estas ideas para desarrollar y crear nuevas formas de utilización en las bibliotecas.
Archivado en: General | Etiquetas: Aprendizaje 2.0, Enseñanza 2.0, Higher Education Academy Subject Centre for Information and Computer Sciences (ICS)
Higher Education Academy Subject Centre for Information and Computer Sciences (ICS) abre una convocatoria de subvenciones para el desarrollo de la enseñanza y el aprendizaje, por un importe total de 35.000 libras, con un máximo de 3.500 libras para cada proyecto en concreto.
Los proyectos deben enmarcarse en alguno de los temas del siguiente programa.
- Promoción y difusión del aprendizaje y la enseñanza efectiva.
- Animación del desarrollo e intercambio de técnicas innovativas
- Desarrollo de buenas prácticas en la evaluación de métodos de enseñanza
- Incremento delperfil investigador pedagógico en la ciencias informáticas y de la información
Los proyectos deben estar dirigidos a la enseñanza superior y centrados en los siguientes puntos:
- Compromiso con el estudiante
- Aumento de la calidad
- Educación para un desarrollo sostenible
En la página de Higher Education Academy Subject Centre for Information and Computer Sciences (ICS) puede consultarse el resto de la información sobre plazos y requisitos.
Archivado en: General | Etiquetas: Academic Commons, gripe A (H1N1), gripe porcina, investigación
En Academic Commons, el repositorio de la Universidad de Columbia, encuentro este pre-print que analiza las tres grandes pandemias de la gripe A en el siglo XX, 1918, 1957, 1968.
Inter-Host Reassortment Patterns in Swine Influenza Viruses
El estudio se realizó por Raul Rabadan y Hossein Khiabanian and Vladimir Trifonov, investigadores del Biomedical Informatics Department de la Universidad de Columbia.

Archivado en: General | Etiquetas: luna, Nature Publishing, Twitter, Web 2.0
Pues está claro que ni el pasado se libra de las nuevas tecnologías…
Para celebrar los 40 años de la llegada del hombre a la luna, Nature examina el legado de las misiones del Apolo y su influencia en la ciencia lunar.
En Nature news se puede acceder libremente a esta revisión del pasado y previsión del futuro, mediante cronologías interactivas, galerías de imágenes y entrevistas. Muy entretenido y ameno para los ajenos al tema.
Pero el “must” de esta iniciativa radica en revivir paso a paso la aventura del Apolo a través de Twitter. También se ha creado un blog con información adicional sobre el contexto de la misión y sus repercusiones en la ciencia y la sociedad en general.

Archivado en: General | Etiquetas: Edición semántica, Nature Publishing, Repositorios, Semantic publishing, Web semántica, XML
En este mes de agosto Nature Publishing Group lanza dos importantes novedades en su web y en sus revistas:
1. MarkLogic Server para poner en marcha una plataforma de búsqueda mejorada
Implantación de un repositorio de XML, desarrollado por MarkLogic., que se traduce en una plataforma de búsqueda que supone una recuperación de la información más rápida, eficaz y actualizada.
El funcionamiento es fácil, el servidor de MarkLogic extrae automáticamente los metadatos de los artículos añadiéndose a la base de datos.
El repositorio trabaja sobre todas las series de Nature e incluso sobre Nature news, y sobre la plataforma de Palgrave E-Boook, y Palgrave Connect.
2. Enriquecimiento semántico de los archivos PDF
Mediante la incorporación de XMP (eXtensible Metadata Platform, Plataforma Extensible de Metadatos) a los PDF de Nature. El proyecto ha sido desarrollado por The Charlesworth Group, consistente en la implantación de un sistema automatizado que extrae información de los archivos XML y la convierte en archivos PDF standarizados y validados con los metadatos XMP emebebidos en el PDF.
De esta manera los datos bibliográficos: título, autor, palabras clave, copyright y materia pueden ser embebidos dentro del documento PDF en un formato que no solamente puede ser entendido por la mente humana sino también por ordenadores, robots de búsqueda, plataformas de búsqueda, etc.
