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La creciente importancia del “Data Sharing”
noviembre 22, 2010, 9:25 pm
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Desde que en 2003 se aprobara la Declaración de Berlín sobre el  Open Access, la apertura y libre difusión del conocimiento científico ha ido ganando terreno, seguidores y adeptos día a dia.

 Quizás no tanto en un país como el nuestro, pero sí en el acervo científico internacional.

 Las grandes editoras STM incorporan desde hace varios años títulos en OP, o liberan años retrospectivos o incluyen la posibilidad de publicar en OP y depositar el artículo en un repositorio institucional.

 Pero dando un paso más allá, aquella parte de la comunidad científica que cree en el conocimiento abierto, ha ido compartiendo los datos primigenios de las investigaciones científicas, conscientes de que este material crudo puede ser una materia prima fundamental para que una misma línea de investigación de resultados diferentes y complementarios. El auténtico trabajo colaborativo.

 El caso más conocido y exitoso, el mapa de la secuencia del genoma humano.  Ya en 1.996, en un encuentro celebrado en las Islas Bermudas, por Human Genome Project (HGP), se diseñó e implementó una política de rápida liberalización de datos  para el intercambio entre los centros internacionales de la secuencia del genoma humano, los cuales se reservaron el derecho de ser los primeros en describir y analizar el conjunto de datos completos en publicaciones “peer-review”. El resultado fue que el trabajo colaborativo condujo a nuevas ideas y descubrimientos e información sobre 30 nuevos genes antes de la publicación del mapa completo del genoma humano.

En vista del éxito de esta rápida liberalización de los “raw data” , en 2009, el Centro de Canadá, celebró un Workshop para la estandarización y el establecimiento de políticas internacionales que faciliten este proceso, así como la creación de nuevos bancos de datos para las ciencias de la vida.

 Sin embargo, la liberalización de los datos brutos supone a día de hoy varios problemas y controversias.

 1. El flujo de trabajo del científico, muchos no archivan sus datos o lo hacen en formatos no intercambiables y por tanto de difícil recuperación.

2.  Clasificación de los datos, pueden ser útiles a varias subdisciplinas dentro de una misma.

3. Cantidad y calidad de los datos, recolectar y archivar gran cantidad de datos por los centros pertinentes, puede significar una pérdida de tiempo considerable para el científico, ya que dentro de cada “set” puede haber cantidades de datos no  relevantes. Se plantea la necesidad de una selección previa para un archivo eficiente de datos útiles, pero también una normalización sobre este tipo de decisiones.

 4. Estandarización de los formatos, punto básico para que puedan ser compartidos y recuperados.

5. Utilización legal de los datos, para evitar el plagio o  las malas prácticas.

Si hasta ahora las organizaciones gubernamentales de apoyo a la ciencia y asociaciones de científicos sin ánimo de lucro lideraban este proyecto, el testigo se recoge por las alguna de las editoriales STM más receptivas a los movimientos de liberalización de conocimiento científico, lo que demuestra que el “data sharing” cada vez cobra más fuerza dentro del panorama investigador internacional.

 Entre ellas,  Nature Publishing Group, que ha puesto en marcha dos proyectos para normalizar las buenas prácticas en la pre-publicación del “data sharing”.

 El primero en colaboración con The National Human Genome Research Institute y Human Microbiome Project, Nature Precedings y Nature Genetics, tiene como objetivo fomentar entre la comunidad científica, el intercambio de datos antes de su publicación.

 El segundo, se orienta hacia la estandarización del proceso y de los datos, para crear archivos estables y citables dentro de la comunidad científica.

 La segunda parte de BioMed Central, a través de su publicación, BMC Research Notes, y dirigida a fomentar las buenas prácticas en la normalización, publicación y “sharing” de los datos.

 BMC Research Notes pone a disposición de los autores que quieran publicar una guía sobre los estándares específicos para  datos. Pero considerando que han de ser los mismos científicos los que decidan cuál es el formato más adecuado.

 A call for BMC Research Notes contributions promoting best practice in data standardization, sharing and publication

 El terreno está abonado para una mayor transparencia e intercambio de datos a nivel internacional, sólo queda saber si los científicos españoles se unirán a esta corriente de conocimiento abierto o no…. Esta humilde transcriptora de noticias, espera fervientemente que sea así….



Open access para los Premios Nobel
octubre 19, 2010, 6:50 pm
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La concesión de los premios nobel de física, medicina y química ha producido una reacción en cadena en los principales editores STM que han liberado los artículos de investigación publicados por los galardonados.

 Uan buena noticia para todos aquellos que quieran leer los trabajos que han ido conformando la carrera hacia el Nobel de Robert G Edwards, Richard Heck, Ei-ichi Negishi y Akira Suzuki, Andre Geim y Konstantin Novoselov, aunque sin duda no deja de ser una estupenda  política de marketing y de prestigio para las editoriales STM que os relacionamos a continuación:

Reproduction: the journal of the Society for Reproduction and Fertility y Journal of endocrinology

American Institute of Physics

Wiley Online Library

IEEE

Y Nature News que publica este interesante artículo:

Clever coupling catalysts lauded by chemistry Nobel
 


Programa Curso práctico Community Manager ¿sabes lo que es? noviembre 2010
octubre 18, 2010, 7:39 pm
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Os presentamos un magnífico curso-seminario sobre la figura del Commnunity Manager, Programa Curso práctico Community Manager ¿sabes lo que es? noviembre 2010

Últimamente se está hablando mucho del community manager como gestor y dinamizador de una estrategia digital de una marca, es más, hay quien dice que es una profesión con mucha perspectiva de futuro. Pero realmente sabemos qué es un community manager?

Personalmente me gusta esta definición:

“Es el arte de la gestión eficiente de la comunicación de otros online en las diferentes herramientas idóneas para el tipo de conversación que creamos conveniente con nuestros potenciales clientes (ya sea un blog, una comunidad a medida, una cuenta en Twitter, una Página de Fans en Facebook…). Es el rostro de la marca.”

David Coghlan, profesor en Trinity Collage de Dublín, Stephanie Falla Aroche para Maestros del Web.

El programa es absolutamente completo, cubre todos los ámbitos en los que el community manager puede desplegar su buen hacer, y tal vez os sorprendan los múltiples campos en los que un CM además de comunicador, gestor, dinamizador, es también generador de contenidos de calidad, responsable de la ética de la marca o institución, o es en sí mismo una marca.

La asistencia al curso supone la concesión de dos créditos de libre elección y el precio 50 euros para profesionales, y 30 para alumnos y antiguos alumnos.



Webcomic: China en Madrid
febrero 17, 2010, 10:31 pm
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Recojo esta interesantísima iniciativa China en Madrid del Instituto de Humanidades de la Universidad Rey Juan Carlos, explicado estupendamente por Gerardo Macías en su blog Tierra de Nadie.

Espero que os guste¡¡¡¡¡¡¡¡¡¡



Más “semantic publishing”: Semantic Biochemical Journal
diciembre 23, 2009, 8:52 pm
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La editorial Portland Press Limited pone en marcha un nuevo concepto de artículo científico editado en formato PDF interactivo. Este proyecto se desarrolla en su revista insignia, Biochemical Journal.

 Portland Press se ha decantado por el software de publicación semántica Utopia. Este software ha sido desarrollado por School of Computer Science de la Universidad de Manchester.

En un primer estadio los desarrolladores se centraron en la creación de una serie de herramientas interactivas para el análisis de la secuencia y estructura de las proteínas, pero posteriormente ampliaron sus objetivos a otras áreas de la biología, ciencias de la vida y de la salud.

Las funcionalidades que este sistema de publicación semántica introduce en el formato PDF coinciden con algunas de las mejoras semánticas añadidas en los documentos HTML, Adventures in Semantic Publishing: Exemplar Semantic Enhancements of a Research Article, David Shotton, Portwin K, Klyne G, Miles A.

El PDF semántico convierte las imágenes estáticas, tablas y texto en objetos que contienen hipervínculos y que pueden ser visualizados, anotados y analizados interactivamente. Los términos y frases contienen links a web externas, glosarios y bases de datos.  Y datos de valor añadido como vídeos e imágenes pueden ser embebidos en el texto con links a herramientas interactivas para manipular secuencias de las proteínas y ver las estructuras moleculares en 3D.

Biochemical Journal ofrece los artículos en PDF convencional y PDF enriquecido. Sin embargo para visualizar y utilizar todas las funcionalidades del nuevo PDF es necesario descargarse en el PC o Mac el sotfware Utopia, descarga sumamente fácil y rápida.

Una breve guía de Utopia Documents



Encuesta sobre el Acceso Abierto en la Agricultura y Ciencias Afines
diciembre 1, 2009, 6:24 pm
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Quisiera desde este pequeño blog, contribuir a la difusión de esta iniciativa, que consiste en recopliar datos e información sobre estado del Acceso Abierto (OA) y la Open Archives Initiative (OAI), en la Comunidad de la Investigación en Agricultura.

El proyecto parte del CIARD (Coherence in Information for Agricultural Research for Development) y se denomina Routemap to Information Nodes and Gateways (RING).

El resultado de la encuesta estará disponible a finales de enero de 2010 en la web del CIARD RING.

Y tal como se explica en la web, difilmente se pueden crear servicios de valor añadido sin saber lo que efectivamente ya está hecho. Así que una vez recopilada la información pertinente, se trata de recuperar el vínculo perdido entre los servicios existentes y sobre ellos crear otros nuevos.

La encuesta está disponbible en español, inglés y francés.

Y añado un slide de Stephen Rudgard en el que se expone con claridad meridiana la importancia de una organización como CIARD.

 



Blogs. La conversación
noviembre 3, 2009, 6:12 pm
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El próximo 11 de noviembre se celebrará la cuarta edición de Blogs. La conversación, en la Universidad Politécnica de Madrid.

Creo que se trata de  una cita intersantísima tanto por el contenido, como por los ponentes y organizadores.

Organizadores:

Octavio Isaac Rojas Orduña Director general de túatú social media & pr.

Elvira San Millán, responsable del programa de Universidad Digital Saludable, URJC, vinculada con la RSC, y community manager del Instituto de Humanidades URJC

Elena Berga, asesora estudiantes de ingeniería en la UPM y de públicos  heterogéneos

Contenidos:

RRPP en un mundo híperconectado
Revolución Política en Internet
Las Crisis e Internet
Blogs y Nostalgia

Y como novedad, I Concurso Iberoamericano de VideoBlogs y además después se celebrará otro beers and blogs.

Altamente recomendado para todos aquellos que crean en la red y la libre comunicación.




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